Основная цель деятельности Управления – повышение эффективности работы Академии по реализации образовательных программ, направленных на подготовку служителей и религиозного персонала религиозных организаций, специалистов по исламской теологии и иных специалистов в соответствии с требованиями федеральных государственных образовательных стандартов, образовательных стандартов, Устава Академии, а также координация, осуществление эффективного контроля за образовательной деятельностью структурных подразделений, подведомственных Управлению образования и кафедр в рамках основного образовательного процесса высшего образования в соответствии с лицензионными и аккредитационными требованиями.