Тематика прошедших защиту диссертаций посвящена в первую очередь возрождению отечественного богословия и охватывает научные проблемы в трудах Ш. Марджани, Г. Курсави, М. Иманкулыя, М. Уради, А. Заяди, Г. Кумухи, имама Шамиля и других богословов Волго-Уральского региона и Кавказа. Имеются также диссертации, посвященные трудам зарубежных богословов. Основная часть работ посвящена проблемам исламского права, некоторые диссертации выполнены в виде научно-богословского редактирования (тахкык), связанного с исследованием ранее не изученных рукописей богословов России и введением их в научный оборот.
Выпускникам Академии оказывается содействие в подготовке к изданию монографий на основе своих докторских диссертаций.
